第453章 都是基本操作,大家先坐下
不是可能存在,而是一定存在。
因为制备样本中的rrna占到了总rna的80%以上。
这样在测序时,准确性必然会受到无可估计的影响。
“梅林,你的担心是正确的。”陆时羡给予他认可的眼神道:“因此我们必须通过rna富集的方法去除rrna的干扰。”
说到这里,就算几人再迟钝脑中也迅速想起一个字眼。
“oligo-dt富集法?”
“没错。”陆时羡打了个响指:“虽然剔除rrna后进行wta也有人使用,但在学界里,由于样本质量的高效性,一般都适用oligo-dt对poly(a)rna进行富集。”
“rrna剔除法较之于oligo-dt富集的缺陷是要求更高的测序深度,不然样本的rrna依然会存在一定的数量,富集效果并没有达到想要的程度。”
这话说的已经非常直白了,以至于后面的操作流程都无需继续强调了。
不过陆时羡还是非常认真地继续着接下来地进行操作。
然后,才终于来到了最后的测序环节
这就是会议上曼伦教授要求陆时羡小组所做的全部工作。
看似只有两个字,但需要完成的工作实则非常繁琐和细致。
三人接下来停止了手里的工作,围站在陆时羡周围看着他操作。
俗话说外行人看热闹,内行人看门道。
别人可能看的一头雾水,但他们还不至于连操作的内容都看不懂。
对rna进行片段化及纯化操作。
对片段化rna的产量及片段大小分布进行分析。
对cdna进行反转录、纯化以及扩增,选择适宜的片段大小建立扩增文库。
对扩增后dna产量及片段大小的分布进行分析。
而此时的鲍勃简直惊呆了,一旁的梅林和瑟琳也有些震撼。
因为操作到这一步,也就是他们三人之前一直在练习熟练的环节。
鲍勃眼睛睁大,有些不可思议地说道:“陆博士?这种精细的微观实验操作,你的动作似乎比之前还要快了。”
其实,他并不是第一次和陆时羡合作实验的萌新。
作为主攻方向为生物技术的研究生,他的实验操作技术在实验室里其实算的上是一把好手。
这跟他之前喜欢观摩很多同学、教授甚至是耶鲁实验大牛的实验操作过程分不开。
比他菜的他喜欢看,这样就像学长学姐幸灾乐祸地看低年级新生顶着烈日进行体检一样,让他很有优越感和成就感。
比他强的他也喜欢看,因为一次优秀的实验操作就像是放映一场电影特效大片。
流畅、清晰、震撼、动人心魄。
但也因此给他更大的惊讶感。
就算在顶级实验室里,你也可以不懂原理,但你绝不能不懂操作。
在这里,操作就是重中之重。
这就存在很多研究生其实压根不是这个专业或者研究方向的,但由于实验技术娴熟被留在实验室里地情况。
之前由于菲斯教授的要求,陆时羡其实已经在他们面前表演过测序操作。
但当时的陆时羡整个操作还显得平缓,虽然在过程中慢慢变的流畅,但还在他们的可接受范围之内。
可现在,陆时羡的操作简直像是侵淫这项技术十数年的老手。
不过这个技术都才刚出来,他们自然将这个可能性视为天方夜谭。
那么就只能归功于陆时羡非同一般的实验操作天赋了。
不过,这一点确实如此。
上一世,陆时羡能够成为老板的头号打工人,相反并不是因为他的学术天赋和直觉有多好。
而是因为他从本科就开始崭露头角的实验操作技术。
正是凭借着这个东西,他才能混迹在学校的各种项目中,攒够保研所需的第一桶金。
但操作这个东西受制于平台大小的程度更甚于理论研究。
混的时间再久,他所得到的大多只是国内的期刊成果。
就算偶有sci,也只是无关紧要的署名而已。
所以工具再趁手,它也只是一件工具而已。
然后,自从重生后。
他已经在历次的实验中,感受到自己的实验操作似乎在上一世的基础上又有所精进。
老练的经验加上充沛的精力造就了这一点。
这也是陆时羡如此有信心完成测序工作的理由之一。
不过,无论是现在还是遥远地将来,他从不满足于成为所谓的工具。
在日渐默契地合作中、加班加点地爆肝中以及他超快的测序效率中,陆时羡在第七天,也就是第一个星期结束前完成了所有测序工作。
测序自然不可能结束,准确地说来,是实验完成了。
整整七天的时间,连续爆肝地他简直累的像条狗,声音说出口都满是疲惫。
好在结果是令人满意的,得到的实验数据初步符合事实规律。
到了这一步,除了依旧沉稳的梅林,鲍勃和瑟琳都是神色激动,振奋不已。
这个时间点结束显然远远超出他们的预期。
“太牛了,我愿之为最强,短短七天做到奥克兰大学研究团队研究数月的进度。”
“难以想象,我竟然参与其中并且完成了这项创举!”
“虽然有吹捧的嫌疑,但我想说,陆博士似乎从来没让人失望过,哪怕一次。”
鲍勃、瑟琳和梅林三人依次发表了体会感言。
“都是基本操作,大家先坐下。”陆时羡微微一笑,然后只是一句话就引发了几人的惊呼。
“事实上,我们小组的工作只完成了一半,我们还有七天的时间。”
此言一出,几人都呆住了。
“陆博士,你的意思是?”鲍勃收敛笑意,有些疑问地代表其他人问道:“难道你想......”
陆时羡点点头:“没错。”
“我们组的任务本来就包含后续的数据分析处理。”
“虽然曼伦教授给我们的任务是完成测序操作,但并未制止我们完成剩下的工作,也就是说我们有提前七天的功夫来完成这个工作。”
“当然,这也就需要大家付出更多的努力和精力,大家都愿意吗?”
砰!
听闻此句,原本坐下的鲍勃眼睛一亮,唰地一声猛然站起。
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因为制备样本中的rrna占到了总rna的80%以上。
这样在测序时,准确性必然会受到无可估计的影响。
“梅林,你的担心是正确的。”陆时羡给予他认可的眼神道:“因此我们必须通过rna富集的方法去除rrna的干扰。”
说到这里,就算几人再迟钝脑中也迅速想起一个字眼。
“oligo-dt富集法?”
“没错。”陆时羡打了个响指:“虽然剔除rrna后进行wta也有人使用,但在学界里,由于样本质量的高效性,一般都适用oligo-dt对poly(a)rna进行富集。”
“rrna剔除法较之于oligo-dt富集的缺陷是要求更高的测序深度,不然样本的rrna依然会存在一定的数量,富集效果并没有达到想要的程度。”
这话说的已经非常直白了,以至于后面的操作流程都无需继续强调了。
不过陆时羡还是非常认真地继续着接下来地进行操作。
然后,才终于来到了最后的测序环节
这就是会议上曼伦教授要求陆时羡小组所做的全部工作。
看似只有两个字,但需要完成的工作实则非常繁琐和细致。
三人接下来停止了手里的工作,围站在陆时羡周围看着他操作。
俗话说外行人看热闹,内行人看门道。
别人可能看的一头雾水,但他们还不至于连操作的内容都看不懂。
对rna进行片段化及纯化操作。
对片段化rna的产量及片段大小分布进行分析。
对cdna进行反转录、纯化以及扩增,选择适宜的片段大小建立扩增文库。
对扩增后dna产量及片段大小的分布进行分析。
而此时的鲍勃简直惊呆了,一旁的梅林和瑟琳也有些震撼。
因为操作到这一步,也就是他们三人之前一直在练习熟练的环节。
鲍勃眼睛睁大,有些不可思议地说道:“陆博士?这种精细的微观实验操作,你的动作似乎比之前还要快了。”
其实,他并不是第一次和陆时羡合作实验的萌新。
作为主攻方向为生物技术的研究生,他的实验操作技术在实验室里其实算的上是一把好手。
这跟他之前喜欢观摩很多同学、教授甚至是耶鲁实验大牛的实验操作过程分不开。
比他菜的他喜欢看,这样就像学长学姐幸灾乐祸地看低年级新生顶着烈日进行体检一样,让他很有优越感和成就感。
比他强的他也喜欢看,因为一次优秀的实验操作就像是放映一场电影特效大片。
流畅、清晰、震撼、动人心魄。
但也因此给他更大的惊讶感。
就算在顶级实验室里,你也可以不懂原理,但你绝不能不懂操作。
在这里,操作就是重中之重。
这就存在很多研究生其实压根不是这个专业或者研究方向的,但由于实验技术娴熟被留在实验室里地情况。
之前由于菲斯教授的要求,陆时羡其实已经在他们面前表演过测序操作。
但当时的陆时羡整个操作还显得平缓,虽然在过程中慢慢变的流畅,但还在他们的可接受范围之内。
可现在,陆时羡的操作简直像是侵淫这项技术十数年的老手。
不过这个技术都才刚出来,他们自然将这个可能性视为天方夜谭。
那么就只能归功于陆时羡非同一般的实验操作天赋了。
不过,这一点确实如此。
上一世,陆时羡能够成为老板的头号打工人,相反并不是因为他的学术天赋和直觉有多好。
而是因为他从本科就开始崭露头角的实验操作技术。
正是凭借着这个东西,他才能混迹在学校的各种项目中,攒够保研所需的第一桶金。
但操作这个东西受制于平台大小的程度更甚于理论研究。
混的时间再久,他所得到的大多只是国内的期刊成果。
就算偶有sci,也只是无关紧要的署名而已。
所以工具再趁手,它也只是一件工具而已。
然后,自从重生后。
他已经在历次的实验中,感受到自己的实验操作似乎在上一世的基础上又有所精进。
老练的经验加上充沛的精力造就了这一点。
这也是陆时羡如此有信心完成测序工作的理由之一。
不过,无论是现在还是遥远地将来,他从不满足于成为所谓的工具。
在日渐默契地合作中、加班加点地爆肝中以及他超快的测序效率中,陆时羡在第七天,也就是第一个星期结束前完成了所有测序工作。
测序自然不可能结束,准确地说来,是实验完成了。
整整七天的时间,连续爆肝地他简直累的像条狗,声音说出口都满是疲惫。
好在结果是令人满意的,得到的实验数据初步符合事实规律。
到了这一步,除了依旧沉稳的梅林,鲍勃和瑟琳都是神色激动,振奋不已。
这个时间点结束显然远远超出他们的预期。
“太牛了,我愿之为最强,短短七天做到奥克兰大学研究团队研究数月的进度。”
“难以想象,我竟然参与其中并且完成了这项创举!”
“虽然有吹捧的嫌疑,但我想说,陆博士似乎从来没让人失望过,哪怕一次。”
鲍勃、瑟琳和梅林三人依次发表了体会感言。
“都是基本操作,大家先坐下。”陆时羡微微一笑,然后只是一句话就引发了几人的惊呼。
“事实上,我们小组的工作只完成了一半,我们还有七天的时间。”
此言一出,几人都呆住了。
“陆博士,你的意思是?”鲍勃收敛笑意,有些疑问地代表其他人问道:“难道你想......”
陆时羡点点头:“没错。”
“我们组的任务本来就包含后续的数据分析处理。”
“虽然曼伦教授给我们的任务是完成测序操作,但并未制止我们完成剩下的工作,也就是说我们有提前七天的功夫来完成这个工作。”
“当然,这也就需要大家付出更多的努力和精力,大家都愿意吗?”
砰!
听闻此句,原本坐下的鲍勃眼睛一亮,唰地一声猛然站起。
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